4-Amino-3-chlorobenzotrifluoride ถูกใช้หลักly เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา ซึ่งช่วยในการป้องกันพืชและเพิ่มผลผลิต นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนาสีย้อมและเม็ดสีบางชนิด เพื่อเพิ่มความเสถียรของสีและประสิทธิภาพในการใช้งานอุตสาหกรรม กลุ่ม trifluoromethyl ของสารนี้ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะ โดยเฉพาะในเคมียารักษาโรคสำหรับการค้นพบและพัฒนายา