5-Bromo-2-chloro-4-fluoroaniline ถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งโบรมีน คลอรีน และฟลูออรีน ทำให้เหมาะสำหรับการปรับปรุงสมบัติทางเคมีและชีวภาพของสารเป้าหมาย มักนำไปใช้ในการผลิตยารักษาโรค สารกำจัดศัตรูพืช และสารเคมีเฉพาะทางอื่น ๆ ที่ต้องการความแม่นยำในการออกแบบโมเลกุล นอกจากนี้ ยังสามารถนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารใหม่ ๆ ในห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษาประสิทธิภาพและกลไกการทำงานของสารต่าง ๆ