5-Bromo-2,4-difluoroaniline ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรกรรม มีบทบาทสำคัญในการผลิตสารออกฤทธิ์สำหรับยา โดยเฉพาะยาที่ใช้ต่อสู้กับการติดเชื้อแบคทีเรียหรือโรคเชื้อรา นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยปกป้องพืชผลและเพิ่มประสิทธิภาพการเกษตร โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้สามารถนำอะตอมโบรมีนและฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลที่ซับซ้อน เพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียร