ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาฟลูออรีนและสารเคมีเกษตรเนื่องจากมีกลุ่มเพอร์ฟลูออโรอัลคิลที่เสถียรและหน้าที่อะมีนที่ทำปฏิกิริยาได้ คลอรีนที่ดึงอิเล็กตรอนและสารย่อยเพอร์ฟลูออรีนช่วยเสริมความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิกในสารออกฤทธิ์ ใช้บ่อยในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา โดยแกนอะโรมาติกฟลูออรีนช่วยปรับปรุงชีวเภสัชจลนศาสตร์และความจำเพาะต่อเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในโพลิเมอร์เฉพาะทางและวัสดุฟังก์ชันนัลที่ต้องการความต้านทานความร้อนและเคมี