ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาปรับสภาพจิต โครงสร้างที่มีพิเพอราซีนทำให้มีศักยภาพในการจับกับตัวรับสารสื่อประสาทหลายชนิด จึงถูกนำไปใช้พัฒนายาใหม่ที่ต้องการความจำเพาะต่อตัวรับเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารอ้างอิงหรือตัวกลางในกระบวนการวิเคราะห์ทางเคมีในห้องปฏิบัติการวิจัย