สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้หลักในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับตัวแทนบำบัดต่างๆ โครงสร้างที่ไม่เหมือนใคร ซึ่งมีทั้งกลุ่มไดฟลูออโรเมทอกซีและกลุ่มฟลูออโร ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำคัญในเคมียารักษา โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้นและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม มักถูกนำมาใช้ในการผลิตยาที่เล็งเป้าไปยังตัวรับหรือเอนไซม์เฉพาะ ซึ่งมีส่วนช่วยในการรักษาโรคต่างๆ เช่น การอักเสบ มะเร็ง หรือโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ การนำเข้าไปในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ช่วยให้สามารถพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ ที่มีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีและสารเคมีพิเศษ