ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่าง ๆ กลุ่ม difluoromethyl ของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ bioavailability ของโมเลกุลที่ได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเคมีเกษตรสำหรับพัฒนายาฆ่าแมลงและวัชยากรใหม่ ๆ โดยอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติเฉพาะ