2,3,6-Trichloroaniline ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี โดยเฉพาะในการผลิตสีย้อมอะโซ ซึ่งถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมสิ่งทอสำหรับการย้อมผ้า นอกจากนี้ยังเป็นส่วนประกอบสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยในการควบคุมวัชพืชและศัตรูพืชอย่างมีประสิทธิภาพในทางปฏิบัติทางการเกษตร นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาเภสัชบางชนิด โดยทำหน้าที่เป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับโครงสร้างทางเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น บทบาทของมันในการวิจัยทางเคมีรวมถึงการเป็นสารตั้งต้นสำหรับสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ ช่วยในการศึกษาปฏิกิริยาทางเคมีและเส้นทางสังเคราะห์