2,2-ไดฟลูออโรไซโคลบิวเทนคาร์บอกซิลิกแอซิด ถูกใช้หลักๆ ในสาขาเคมีทางการแพทย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งประกอบด้วยวงแหวนไซโคลบิวเทนพร้อมการแทนที่ด้วยฟลูออรีนสองตัว ทำให้มีคุณค่าสำหรับการสร้างโมเลกุลที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้น สารประกอบนี้มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะในการออกแบบตัวยับยั้งโปรติเอสและตัวยารักษาอื่นๆ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตวัสดุขั้นสูงและสารเคมีเกษตร ซึ่งวงแหวนฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มคุณสมบัติทางเคมีและประสิทธิภาพ