ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์เอมีนที่ได้รับการป้องกัน ทำให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ตำแหน่งฟังก์ชันอื่นๆ ได้โดยไม่ถูกรบกวนจากกลุ่มเอมีน หมู่ไอโอดีนช่วยให้สามารถแปลงโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง เช่น Suzuki หรือ Heck couplings ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์สารชีวภาพ เช่น สเตียรอยด์และตัวปรับรีเซพเตอร์ โดยโครงสร้างไซโคลเฮกซิลให้ความแข็งแรงทางโครงสร้าง การป้องกันด้วยเทอร์ต-บิวทิล คาร์บาเมต (Boc) สามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน อนุญาตให้ถอดการป้องกันแบบควบคุมในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน