กวานิดีน ไฮโดรบโรไมด์ เป็นเกลือไฮโดรบโรไมด์ของกวานิดีน ซึ่งเป็นฐานอินทรีย์ที่แรง ใช้เป็นสารโกลาโทรปิกและสารทำให้โปรตีนเสียสภาพในชีวเคมี เพื่อรบกวนปฏิกิริยาที่ไม่ใช่โคเวเลนต์ ช่วยในการศึกษาและการทำให้บริสุทธิ์โปรตีนและกรดนิวคลีอิก ในสังเคราะห์อินทรีย์ ใช้เป็นสารตั้งต้นหรือแหล่งกำเนิดฐานกวานิดีนอิสระ เพื่อช่วยปฏิกิริยาในการผลิตยา สังเคราะห์เปปไทด์ และเตรียมสารประกอบอินทรีย์อื่นๆ นอกจากนี้ยังใช้ในการสกัดและละลายชีวโมเลกุล รวมถึงกระบวนการอุตสาหกรรมบางอย่างสำหรับสีย้อมและสารคงตัว