ไคโตเด็กซ์ทริเนสถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมชีวเทคโนโลยีและอาหาร เนื่องจากความสามารถในการย่อยสลายไคตินและอนุพันธ์ของไคติน ในด้านการเกษตร ถูกนำไปใช้เป็นสารชีวควบคุมเพื่อจัดการเชื้อราโรคพืช โดยการย่อยสลายผนังเซลล์ที่ทำจากไคติน ส่งผลให้ปกป้องพืชผล ในอุตสาหกรรมอาหาร ถูกใช้ในการแปรรูปของเสียที่อุดมด้วยไคตินจากอาหารทะเล เพื่อแปลงเป็นผลิตภัณฑ์ที่มีคุณค่า เช่น ไคโตโอลิโกซาคคาไรด์ ซึ่งมี ứng dụngในอาหารฟังก์ชันนัลและโภชนเภสัช นอกจากนี้ ไคโตเด็กซ์ทริเนสยังมีบทบาทในการผลิตปุ๋ยชีวภาพและสารชีวกำจัดศัตรูพืช สนับสนุนการทำเกษตรยั่งยืน กิจกรรมเอนไซม์ของมันยังถูกสำรวจในงานวิจัยชีวการแพทย์เพื่อพัฒนาสารต้านจุลินทรีย์และวัสดุรักษาแผล