N-acetylneuraminic acid aldolase มีการใช้งานในด้านชีวเคมีและชีวเทคโนโลยี โดยเฉพาะในการสังเคราะห์และวิเคราะห์สารประกอบ N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac) ซึ่งเป็นกรดไซอะลิกชนิดหนึ่งที่สำคัญในกระบวนการทางชีวภาพ เอนไซม์นี้ช่วยในการเร่งปฏิกิริยาการแตกตัวของ Neu5Ac เป็นสารตั้งต้นที่ง่ายกว่า เช่น N-acetylmannosamine และ pyruvate ซึ่งสามารถนำไปใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลอื่น ๆ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และวิถีเมแทบอลิซึมที่เกี่ยวข้องกับกรดไซอะลิก รวมถึงการพัฒนายาและวัคซีนที่เกี่ยวข้องกับเชื้อโรคที่ใช้กรดไซอะลิกในการติดเชื้อ