X-gal ถูกใช้อย่างแพร่หลายในชีววิทยาโมเลกุลเป็นสารตั้งต้นสำหรับตรวจจับกิจกรรมของเอนไซม์ β-galactosidase มีคุณค่าอย่างยิ่งในการคัดกรองสีน้ำเงิน-ขาว ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ระบุแบคทีเรียรีคอมบิแนนต์ เมื่อ X-gal ถูกย่อยสลายโดย β-galactosidase จะเกิดผลิตภัณฑ์สีน้ำเงินที่ไม่ละลาย ทำให้ผู้วิจัยสามารถแยกแยะโคโลนีที่มีและไม่มีเอนไซม์ได้โดยการมองเห็น สิ่งนี้ทำให้เป็นเครื่องมือที่จำเป็นในการทดลองโคลน ซึ่งช่วยระบุการแทรก DNA ที่ประสบความสำเร็จลงในเวกเตอร์ นอกจากนี้ X-gal ยังใช้ในฮิสโตเคมีและชีววิทยาเซลล์เพื่อระบุตำแหน่งกิจกรรมของ β-galactosidase ในเนื้อเยื่อหรือเซลล์ สนับสนุนการศึกษาการแสดงออกของยีนและกระบวนการเซลล์ ความจำเพาะและความง่ายในการใช้งานทำให้เป็นเครื่องมือหลักในห้องปฏิบัติการมานานหลายทศวรรษ