Anhydrotetracycline ใช้หลักในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลเป็นตัวเหนี่ยวนำในระบบการแสดงออกของยีน โดยเฉพาะระบบควบคุมด้วยเตตราไซคลิน (Tet-On/Tet-Off) ซึ่งจับกับโปรตีน transactivators ที่ควบคุมด้วยเตตราไซคลิน ทำให้สามารถควบคุมการถอดรหัสยีนเป้าหมายได้อย่างแม่นยำในเซลล์สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ยีสต์ และเซลล์แบคทีเรีย ต่างจากเตตราไซคลินหรือ doxycycline มันไม่ถูกใช้เป็นยาปฏิชีวนะเนื่องจากขาดกิจกรรมต้านจุลินทรีย์ ทำให้เหมาะสำหรับการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยที่ต้องหลีกเลี่ยงผลกระทบจากยาปฏิชีวนะพื้นหลัง ความสามารถในการเข้าสู่เซลล์อย่างรวดเร็วและควบคุมการแสดงออกของยีนแบบย้อนกลับได้ ทำให้มีคุณค่าในการศึกษาพันธุกรรม การผลิตโปรตีน และกระบวนการเซลล์ในลักษณะที่ควบคุมได้ โดยไม่ก่อให้เกิดพิษต่อเซลล์ในระดับที่ใช้และมีความเฉพาะเจาะจงสูง