ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการพัฒนาโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ หมู่อะมินที่ได้รับการป้องกันด้วย Boc ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรในการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการสร้างฮีเตอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจน โครงสร้าง isoindoline ที่ป้องกันด้วย Boc มีคุณค่าต่อเคมีทางการแพทย์ในการออกแบบยับยั้งโปรติเอส ยับยั้งคินาส และการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายอื่นๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ isoindoline ที่ถูกฟังก์ชันไนซ์สำหรับโปรแกรมค้นพบยา ซึ่งการถอดการป้องกันที่ควบคุมได้ช่วยให้สามารถดัดแปลงเพิ่มเติมได้ นอกจากนี้ ยังสนับสนุนการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งและแนวทางการเคมีแบบรวมกันสำหรับการคัดกรองความสามารถสูงของผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ