ใช้ในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรที่อิงจาก quinoxaline เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันคลอรีนและเอสเตอร์ที่ทำปฏิกิริยาได้ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงสารต้านจุลชีพและต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่มีกิจกรรมบำบัดที่เป็นไปได้ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อพัฒนายับยั้ง kinase ใหม่และสีย้อมเรืองแสง