ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายับยั้งการนำกลับเข้า (SSRIs) และสารออกฤทธิ์อื่นๆ ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) โครงสร้างแกนเบนโซฟูแรนที่ถูกฟลูออรีนเสริมช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับกับตัวรับเป้าหมาย ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียาเพื่อสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ เนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ที่เหมาะสม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ฟลูออรีนในโปรแกรมค้นคว้ายาเพื่อปรับปรุงโปรไฟล์เภสัชจลนศาสตร์