ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านปรสิตและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันสนับสนุนการก่อตัวของอนุพันธ์เบนโซอิมิทาโซลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ซึ่งเป็นที่รู้จักสำหรับการโต้ตอบกับเอนไซม์และตัวรับในเซลล์ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างยาตัวสมัครที่เล็งเป้าไปยังโรคทางเดินอาหาร ความดันโลหิตสูง และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบส่วนผสมออกฤทธิ์ใหม่ในสารป้องกันพืช เนื่องจากความเสถียรและปฏิกิริยาของมันในปฏิกิริยาคัปปลิงต่างๆ สารนี้ยังสามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างได้ง่ายผ่านปฏิกิริยาแทนที่ของหมู่คลอไรด์ หรือการไฮโดรไลซิสของหมู่เอสเทอร์ เพื่อให้ได้สารประกอบที่ต้องการสำหรับการพัฒนายาใหม่