ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาที่มีฟลูออรีนและสารเคมีเกษตร สารประกอบนี้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างฮาโลเจนและเฮเทอโรไซคลิกที่ไม่เหมือนใคร การมีอะตอมคลอรีนและฟลูออรีนที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาในการสร้างโครงสร้างที่ซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการออกแบบตัวยับยั้งคินาสและการบำบัดแบบมีเป้าหมายอื่นๆ ซึ่งวงแหวนฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับ นอกจากนี้ โครงสร้างแกนไซโคลเพนตะไพรีมีดีนที่แข็งยังช่วยเพิ่มความเลือกเฉพาะและประสิทธิภาพในตัวยาที่มีศักยภาพ