ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็น heterocyclic ซึ่งมักพบในโมเลกุลของยา โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาแก้ปวด โครงสร้างที่มี furo[3,4-c]pyridine ช่วยเพิ่มความสามารถในการผ่านเยื่อหุ้มสมองและมีผลต่อการจับกับตัวรับเฉพาะในสมอง ทำให้มีศักยภาพในการพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพได้สูง นิยมใช้ในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนายาใหม่ในห้องปฏิบัติการ