2-Bromo-5-(acetyl-d3)-furan ถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในการผลิตสารประกอบที่มีโครงสร้างฟิวแรน (furan) ซึ่งเป็นโครงสร้างที่พบได้ในหลายสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกระบวนการติดตามไอโซโทป (isotopic labeling) เพื่อทำความเข้าใจกลไกการเกิดปฏิกิริยาและการเปลี่ยนแปลงของโมเลกุลในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ยังอาจถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในขั้นตอนการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือลดผลข้างเคียงของยา