S-Methyl 2-Furancarbothioate ใช้หลักในฐานะสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ การประยุกต์ใช้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารกำจัดศัตรูพืชและสารกำจัดวัชพืช สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเภสัชภัณฑ์เพื่อเตรียมผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางเอนไซม์เฉพาะ นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารปรุงรสและน้ำหอม ซึ่งช่วยสร้างโปรไฟล์กลิ่นที่ซับซ้อนในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องสำอาง คุณสมบัติการตอบสนองและโครงสร้างของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์และกระบวนการผลิตทางเคมี