Methyl 4-cyanofuran-2-carboxylate ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันที่มีทั้งกลุ่มไซยาโนและเอสเตอร์คาร์บอกซิเลต ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ในเคมียารักษาโรค มันถูกใช้ในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ เช่น ยาต้านการอักเสบ ต้านไวรัส หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในการออกแบบยาใหม่และส่วนผสมที่ใช้งานได้สำหรับการป้องกันพืช ความตอบสนองของมันอนุญาตให้มีการปรับแต่งเพิ่มเติม ทำให้ผู้วิจัยสามารถปรับคุณสมบัติของมันสำหรับการใช้งานเฉพาะในงานวิจัยทางเคมีและชีวภาพ