2-Bromo-5-methylfuran นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีภัณฑ์ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการค้นหายาที่มีประสิทธิภาพ เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังอาจพบการใช้งานในห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกลไกการเกิดปฏิกิริยาต่าง ๆ