กรด 5-เมทอกซิเมทิล-2-ฟูโรอิก ถูกนำมาใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการพัฒนาสารประกอบทางเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างแหวนฟูแรนของมันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการหมู่ย่อยจากฟูแรน นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการสร้างสารเคมีพิเศษ รวมถึงสารเคมีเกษตรและสารเคมีละเอียด ซึ่งกลุ่มฟังก์ชันของมันสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อให้ได้คุณสมบัติที่ต้องการ ความหลากหลายของสารนี้ยังขยายไปถึงการใช้งานในการวิจัยและพัฒนาเพื่อสำรวจปฏิกิริยาเคมีใหม่ๆ และเส้นทางเคมีในเคมีอินทรีย์