Azide-PEG3-Desthiobiotin ถูกใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการทางชีวเคมีและอณูชีววิทยา โดยเฉพาะในการติดฉลากและแยกโปรตีนหรือโมเลกุลเป้าหมาย ด้วยคุณสมบัติของ azide group ที่สามารถทำปฏิกิริยาแบบ click chemistry กับ alkyne หรือ cyclooctyne ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุล นอกจากนี้ desthiobiotin ที่อยู่ในโครงสร้างยังสามารถจับกับ streptavidin หรือ avidin ได้แบบย้อนกลับ (reversible binding) เนื่องจากมี affinity ที่ต่ำกว่า biotin ช่วยให้สามารถแยกและทำความสะอาดสารตัวอย่างในกระบวนการ affinity purification ได้ง่ายโดยการแข่งขันกับ biotin การใช้ PEG3 linker ช่วยเพิ่มความยืดหยุ่นและความเสถียรของโมเลกุล ทำให้เหมาะสมสำหรับการประยุกต์ใช้ในระบบชีวภาพต่าง ๆ เช่น การศึกษาโปรตีน-โปรตีนอินเทอแรคชัน การสร้างโปรบ์สำหรับการถ่ายภาพเซลล์ และการพัฒนายาหรือสารวินิจฉัยแบบมุ่งเป้า