S-Acetyl-PEG3-alcohol ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและชีวเทคโนโลยีในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานที่หลากหลายสำหรับการพัฒนายาและการเชื่อมต่อสารประกอบ การประยุกต์ใช้หลักอยู่ที่การสังเคราะห์โปรดรัก (prodrugs) โดยทำหน้าที่เป็นกลุ่มปกป้องสำหรับหมู่ฮีดรอกซิล (hydroxyl functionalities) ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของส่วนประกอบเภสัชกรรมที่ออกฤทธิ์ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสร้างอนุพันธ์ polyethylene glycol (PEG) ซึ่งมีความสำคัญในการปรับปรุงความสามารถในการละลาย ระยะเวลาการไหลเวียน และประสิทธิภาพของตัวแทนบำบัด นอกจากนี้ยังมีบทบาทในกลยุทธ์การเชื่อมต่อทางชีวภาพ (bioconjugation) ซึ่งช่วยให้สามารถติดยา เพปไทด์ หรือโปรตีนเข้ากับโซ่ PEG เพื่อการส่งยาแบบกำหนดเป้าหมายและลดภูมิคุ้มกันที่ไม่พึงประสงค์ กลุ่มอะซิติลของมันช่วยให้สามารถกำจัดกลุ่มปกป้องได้ง่ายภายใต้สภาวะอ่อนโยน ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์และการออกแบบยา