ใช้ในสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารที่มีโครงสร้างเบนซิลิก หรือฟีนิลที่มีหมู่เมทอกซีและหมู่ป้องกัน (protecting group) เช่น MOM (methoxymethyl) ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาในตำแหน่งเฉพาะของโมเลกุล นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์ยา หรือสารชีวภาพที่ซับซ้อน เช่น แอลคาลอยด์ หรือสารธรรมชาติที่มีโครงสร้างฟีนิลโพรเพน หมู่อัลดีไฮด์ทำหน้าที่เป็นจุดเริ่มต้นในการต่อสายโซ่คาร์บอนผ่านปฏิกิริยาเช่น Wittig หรือ aldol condensation ส่วนหมู่ MOM สามารถถอดออกได้ภายหลังเมื่อต้องการเปิดหมู่ -OH อีกครั้งในขั้นตอนสุดท้ายของการสังเคราะห์