เมทิลโนนาโนเอตถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารปรุงแต่งกลิ่นรสในอุตสาหกรรมอาหาร เนื่องจากมีกลิ่นหอมแบบผลไม้และดอกไม้ มักนำไปผสมในผลิตภัณฑ์เช่น ลูกอม อาหารอบ และเครื่องดื่ม เพื่อเพิ่มเสน่ห์ทางประสาทสัมผัส ในอุตสาหกรรมน้ำหอม มันเป็นส่วนประกอบหลักในน้ำหอมและเครื่องสำอาง ให้โปรไฟล์กลิ่นที่น่าพอใจ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิตเอสเทอร์และสารประกอบอินทรีย์อื่นๆ ในด้านเกษตรกรรม เมทิลโนนาโนเอตถูกสำรวจเป็นสารชีวภาพกำจัดศัตรูพืช โดยเฉพาะเป็นสารดึงดูดแมลงสำหรับการควบคุมศัตรูพืช เสนอทางเลือกที่เป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อมแทนยาฆ่าแมลงเคมีแบบดั้งเดิม การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปสู่การวิจัย ซึ่งใช้เป็นสารอ้างอิงในเคมีวิเคราะห์และการศึกษากระบวนการเอสเทอร์การ