5-Methylfurfural ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพและสารเคมีชีวภาพ โดยมีบทบาทในการสังเคราะห์เชื้อเพลิง เช่น 2-methylfuran และ 2,5-dimethylfuran ซึ่งมีค่าออกเทนสูงและมีศักยภาพเป็นน้ำมันเบนซินทดแทนจากพลังงานหมุนเวียน นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์ เรซิน และเคมีภัณฑ์ละเอียด เนื่องจากมีกลุ่มอัลดีไฮด์และฟูแรนที่ทำปฏิกิริยาได้ดี สารอนุพันธ์ของมันถูกสำรวจใช้ในเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร กำลังได้รับความสนใจในเคมีศาสตร์ยั่งยืนสำหรับการแปลงชีวมวลให้เป็นผลิตภัณฑ์ที่มีมูลค่าสูง