อิโซซัฟลูโทลเป็นสารกำจัดวัชพืชที่ใช้ในภาคการเกษตร โดยเฉพาะในพื้นที่เพาะปลูกข้าวโพด มันทำงานโดยการยับยั้งการสังเคราะห์สารที่จำเป็นต่อการเจริญเติบโตของวัชพืช ทำให้วัชพืชที่มีใบเลี้ยงเดี่ยวและใบเลี้ยงคู่บางชนิดไม่สามารถเติบโตได้ สารนี้มักใช้ก่อนการงอกของพืช (pre-emergent) หรือช่วงต้นของการงอก เพื่อควบคุมวัชพืชในระยะเริ่มต้น โดยเฉพาะวัชพืชที่ดื้อยาต่อสารกำจัดวัชพืชชนิดอื่นๆ อิโซซัฟลูโทลมีประสิทธิภาพสูงในการควบคุมวัชพืชที่เป็นปัญหา เช่น หญ้าตีนตุ๊กแก และวัชพืชอื่นๆ ที่ขึ้นในไร่ข้าวโพด การใช้อิโซซัฟลูโทลช่วยลดการแข่งขันระหว่างวัชพืชกับพืชเศรษฐกิจ ส่งผลให้ผลผลิตข้าวโพดสูงขึ้น และลดความจำเป็นในการใช้แรงงานหรือเครื่องจักรในการกำจัดวัชพืช อย่างไรก็ตาม ต้องใช้อย่างระมัดระวังเพื่อหลีกเลี่ยงผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมและพืชที่ไม่ใช่เป้าหมาย