เบนซิลดิซัลไฟด์ถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมยาและสารเกษตรเคมี เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารประกอบที่มีซัลเฟอร์เนื่องจากพันธะดิซัลไฟด์ที่สามารถเกิดปฏิกิริยา redox ได้ ใช้ในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่กระตือรือร้น เช่น สารต้านจุลินทรีย์และต้านเชื้อรา รวมถึงสารต้านอนุมูลอิสระ นอกจากนี้ยังใช้ในสูตรกลิ่นรสและน้ำหอม ให้กลิ่นคล้ายหัวหอมหรือกระเทียมในอุตสาหกรรมอาหารและน้ำหอม ทำหน้าที่เป็นลิแกนด์หรือตัวปรับแต่งในระบบตัวเร่งปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับโลหะทรานซิชัน