1-Fluoropyridinium Tetrafluoroborate ใช้เป็นสารฟลูออรีนเอเจนต์ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเปลี่ยนแอลกอฮอล์เป็นอัลคิลฟลูออไรด์และนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปในสารประกอบอินทรีย์ต่าง ๆ ซึ่งมีคุณค่าอย่างยิ่งในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม เนื่องจากสารประกอบฟลูออรีนมักแสดงกิจกรรมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้นและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบอะโรมาติกฟลูออรีน ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือรีเอเจนต์ในปฏิกิริยาเคมีเฉพาะเจาะจง ช่วยในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนด้วยความแม่นยำสูง ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นตัวเลือกที่นิยมในห้องปฏิบัติการสำหรับกระบวนการฟลูออรีนที่ควบคุมได้