ใช้ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฟลูออรีนเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสามารถในการจับคู่ โครงสร้างแหวนไซโคลบิวเทนที่ตึงเครียดพร้อมสารทดแทนฟลูออรีนทำให้มีคุณค่าต่อเคมีทางการแพทย์สำหรับการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีของยาที่เป็นผู้สมัคร ใช้กันทั่วไปในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์และลิแกนด์ตัวรับ ซึ่งการฟลูออรีนช่วยปรับปรุงการซึมผ่านเยื่อและความต้านทานต่อการย่อยสลายจากออกซิเดชัน นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเคมีเกษตรสำหรับการสร้างส่วนผสมออกฤทธิ์ใหม่ที่มีความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น