ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาบางชนิดที่มีฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งเมแทบอลิซึมและยาที่มุ่งเป้าไปยังเอนไซม์ โครงสร้างฟลูออรีนที่ไม่เหมือนใครช่วยเพิ่มการซึมผ่านเยื่อไขมันและปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในตัวยาที่เป็นผู้สมัคร นิยมใช้ในการวิจัยสำหรับการออกแบบตัวแทนที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากความสามารถในการผ่านกำแพงเลือด-สมอง นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อสร้างส่วนผสมที่ใช้งานได้ที่แข็งแกร่งและมีชีวะประสิทธิผลสูงขึ้น ความเป็นสเตอรีโอเคมีและปริมาณฟลูออรีนทำให้มีคุณค่าในการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR)