2-Fluorocyclohexanone ใช้หลักในฐานะสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างฟลูออรีนของมันมีคุณค่าต่อการนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ ความเสถียร และคุณสมบัติทางเมแทบอลิซึม ในเคมีทางการแพทย์ มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาผู้สมัครยา โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีพิเศษและสารเคมีละเอียด ซึ่ง reactivity ที่เป็นเอกลักษณ์และการแทนที่ด้วยฟลูออรีนมีบทบาทสำคัญในการบรรลุลักษณะผลิตภัณฑ์ที่ต้องการ