สารเคมีนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อนยิ่งขึ้น มันมักถูกนำไปใช้ในการวิจัยทางเภสัชกรรมเพื่อการสร้างส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) เนื่องจากโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งประกอบด้วยอะตอมโบรมีนและฟลูออรีนทั้งสอง ฮาโลเจนเหล่านี้สามารถเสริมสร้างกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ นอกจากนี้ มันยังทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีทางการเกษตร โดยมีส่วนช่วยในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลงที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น ส่วนของ difluoroacetic acid มีคุณค่าอย่างยิ่งในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีของโมเลกุลเป้าหมาย เช่น การเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมัน (lipophilicity) หรือการเปลี่ยนแปลงลักษณะทางอิเล็กทรอนิกส์