ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาที่มีฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนาสารยับยั้งเอนไซม์ ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับมัด หมู่อะมิโนและหมู่กรดคาร์บอกซิลิกของมันช่วยให้สามารถทำการจับคู่เปปไทด์ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรเฉพาะทาง ซึ่งการเพิ่มฟลูออรีนช่วยปรับปรุง lipophilicity และความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม โครงสร้างของมันสนับสนุนการใช้ในเคมีเภสัชกรรมเพื่อสำรวจความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรมในการออกแบบยา