2-Fluoro-3,5-dimethoxybenzoic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการสร้างยารักษาที่ต้องการคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric เฉพาะ สารนี้มักใช้ในการวิจัยเคมียารักษาเพื่อสำรวจศักยภาพในการออกแบบโมเลกุลชีวภาพ เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารเคมีเกษตร ที่ซึ่งรูปแบบการแทนที่ที่ไม่เหมือนใครสามารถช่วยในการพัฒนายาฆ่าหญ้าสารกำจัดศัตรูพืชที่มีกิจกรรมและ selectivity ที่เพิ่มขึ้น การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่วิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ซึ่งสามารถรวมเข้าไปในโพลิเมอร์หรือสารเคลือบเพื่อให้คุณสมบัติทางเคมีหรือทางกายภาพเฉพาะ