กรด 3-โบรโม-6-ฟลูออโร-2-เมทิลเบนโซอิก ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งมีทั้งหมู่โบรโมและฟลูออโร ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง ในเคมียารักษาโรค มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนาผู้สมัครยา โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปที่การยับยั้งเอนไซม์หรือการปรับเปลี่ยนตัวรับ นอกจากนี้ ในงานวิจัยสารเคมีเกษตร ยังช่วยในการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โดยใช้คุณสมบัติทางเคมีเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรร ความหลากหลายของสารนี้ยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งสามารถนำไปรวมในโพลิเมอร์ขั้นสูงหรือสารเคมีพิเศษสำหรับการใช้งานอุตสาหกรรม