ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน เนื่องจากมีทั้งกลุ่มฟังก์ชันไซยาโนและกรดคาร์บอกซิลิก ซึ่งช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา โดยกลุ่มไตรฟลูโอมีทิลช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ bioavailability ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยสำหรับการออกแบบสารประกอบชีวภาพใหม่และในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR)