ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาที่มีฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างอะโรมาติกที่มีการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในยาที่เป็นผู้สมัคร นิยมใช้ในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ในโครงสร้างยา นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและโพลิเมอร์พิเศษ โดยที่บล็อกสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความต้านทานต่อความร้อนและการออกซิเดชัน