ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถสร้างอนุพันธ์อะไมด์และเอสเตอร์ได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการปรับเปลี่ยนความสามารถในการละลาย ความเสถียร และการจับกับเป้าหมายของยา นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโครงสร้างอินทรีย์โคเวเลนต์ (COFs) และโครงสร้างโลหะ-อินทรีย์ (MOFs) เนื่องจากโครงสร้างกระดูกหอมที่แข็งและหน้าที่กรดคาร์บอกซิลิกคู่ ซึ่งสนับสนุนการประสานงานที่แข็งแกร่งกับไอออนโลหะ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการออกแบบโปรบเรืองแสงและเซ็นเซอร์ โดยกลุ่มไตรฟลูโอเมทิลช่วยเพิ่มความชอบไขมันและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม