ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฟลูออรีนทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพ โดยที่อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับ (binding affinity) กลุ่มอัลลิลช่วยให้สามารถฟังก์ชันนาไลซ์เพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาเช่น olefin metathesis หรือ hydroformylation ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์พิเศษและผลึกเหลว โดยที่สารย่อยฟลูออรีนมีผลต่อคุณสมบัติ dielectric และความเสถียรทางความร้อน