ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรมที่มีฟลูออรีน (APIs) ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างอนุพันธ์ที่ลิโพฟิลิกมากขึ้นในการออกแบบยา ซึ่งช่วยปรับปรุงการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) และสารต้านการอักเสบ เนื่องจากความสามารถในการปรับความหนาแน่นของอิเล็กตรอนและส่งผลต่อความสัมพันธ์การจับกับตัวรับเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีเพื่อพัฒนายาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีความคงทนต่อสิ่งแวดล้อมและประสิทธิภาพที่ดีขึ้น