ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาที่มีฟลูออรีน (APIs) ที่ต้องการความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพที่ดีขึ้น โครงสร้างของมันสนับสนุนการนำเข้าไปในโมเลกุลที่มุ่งเป้าไปยังโรคระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านการอักเสบ ฟลูออรีนช่วยเพิ่มการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และความต้านทานต่อการย่อยสลายจากออกซิเดชัน ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการปรับปรุงยาที่มีศักยภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อมและประสิทธิภาพที่ดีขึ้น