ใช้ในงานสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพสูง เช่น ยารักษาโรคมะเร็งหรือโรคทางระบบประสาท โครงสร้างที่มีการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มเสถียรภาพของโมเลกุลและปรับปรุงการดูดซึมในร่างกาย นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างเปปไทด์หรือโปรตีนที่มีคุณสมบัติพิเศษในงานวิจัยด้านชีวเคมี