ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง โซ่ข้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชสำหรับการปรับปรุงยาตัวสมัคร นิยมใช้ในการเตรียมสารยับยั้งเอนไซม์และสารปรับตัวรับ โดยการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความสัมพันธ์ในการจับและคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ ยังใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบส่วนผสมออกฤทธิ์ใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม