ใช้เป็นสารเคมีกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาอนุภาคฟลูออรีนสำหรับยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างแกนไซโคลบิวเทนที่แข็งและกลุ่มอาริลฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและมีอิทธิพลต่อความสัมพันธ์การจับกับตัวรับบางชนิด ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากคุณสมบัติ steric และ electronic ที่ไม่เหมือนใคร นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบต้านการอักเสบและต้านไวรัสใหม่ๆ โดยที่การแทนที่ฟลูออรีนมีบทบาทสำคัญใน bioavailability